Saccharina japonica (Laminariales, Phaeophyta) のニトレート還元酵素遺伝子のクローニングと特性解析

投稿日：2023-02-16

概要

ニトレート還元酵素（NR）は窒素循環において重要な酵素であり、その活性は植物の発育と発達に密接に関係している。
本研究では、海藻のサクシャリナ・ジャポニカのNR遺伝子をクローニングし、特性解析を行った。
NR遺伝子のフルレングスcDNAは1,845 bpの長さであり、オープンリーディングフレーム（ORF）は1,717 bpであり、572個のアミノ酸からなるポリペプチドをコードしていた。
推定されたアミノ酸配列は他の種におけるものと高い類似性を示した。
NR遺伝子の発現は胚珠で最も高く、胚子で最も低かった。
NR遺伝子はニトレートによって誘導され、アンモニウムによって抑制された。
NR遺伝子はアブシジン酸とサリチル酸によって誘導された。
NR遺伝子は細胞質と核に存在した。

詳細な説明

ニトレート還元酵素（NR）は窒素循環において重要な酵素であり、その活性は植物の発育と発達に密接に関係している。本研究では、海藻のサクシャリナ・ジャポニカのNR遺伝子をクローニングし、特性解析を行った。NR遺伝子のフルレングスcDNAは1,845 bpの長さであり、オープンリーディングフレーム（ORF）は1,717 bpであり、572個のアミノ酸からなるポリペプチドをコードしていた。推定されたアミノ酸配列は他の種におけるものと高い類似性を示した。S. japonicaのさまざまな組織でのNR遺伝子の発現を分析した結果、NR遺伝子の発現は胚珠で最も高く、胚子で最も低かった。また、NR遺伝子はニトレートによって誘導され、アンモニウムによって抑制された。NR遺伝子はアブシジン酸とサリチル酸によっても誘導された。NR遺伝子の分子内局在性も調べられた。その結果、NR遺伝子は細胞質と核に存在したことがわかった。これは、NR遺伝子が細胞質と核の両方で役割を果たしている可能性を示唆している。

結論

以上の結果から、サクシャリナ・ジャポニカのNR遺伝子をクローニングし、特性解析を行った。NR遺伝子のフルレングスcDNAは1,845 bpの長さであり、オープンリーディングフレーム（ORF）は1,717 bpであり、572個のアミノ酸からなるポリペプチドをコードしていた。推定されたアミノ酸配列は他の種におけるものと高い類似性を示した。NR遺伝子の発現は胚珠で最も高く、胚子で最も低かった。NR遺伝子はニトレートによって誘導され、アンモニウムによって抑制された。NR遺伝子はアブシジン酸とサリチル酸によっても誘導された。NR遺伝子は細胞質と核に存在した。これらの結果は、S. japonicaの発育と発達におけるNR遺伝子の役割に関するさらなる研究に有用な情報を提供している。

要約した論文について

published: 2023;
Cloning and characterization of nitrate reductase gene in kelp Saccharina japonica (Laminariales, Phaeophyta)

あなたのDNAが、あなた自身やあなたの家族について何を語っているのかを知ることができます。

あなたの遺伝子の構成に関する詳細な情報を提供します。
あなたの健康状態や潜在的な健康リスクについての洞察を提供します。
特定の遺伝的疾患の保因者であることについての情報を提供します。
同じような遺伝的背景を持つ人々のコミュニティへのアクセスを提供します。
最も包括的な祖先の分類の研究において、世界2000以上の地域であなたのDNAがどのように分布しているかを見ることができます。
DNA Relative Finder を使って、過去に検査を受けた近くの親族や遠くの親族を見つけることができます。
ご家族やご友人とレポートを共有することができます。
あなたのDNAが顔の特徴、味覚、嗅覚、その他の特徴にどのような影響を及ぼしているかを知ることができます。

DNA検査キットを購入

like/long-position

dislike/short-position

0 0

-ja

comment Cancel reply

: ja

レタス決定性遺伝子ネットワーク：生物学的機能から治療戦略へ

記事の概要レタス決定性遺伝子ネットワーク（RDGN）は、脊椎動物の網膜の発達に関与しています。 RDGNは、転写因子、シグナル分子、およびその他の調節タンパク質から構成されています。 RDGNは、脊椎動物の網膜の形成に不可欠であり、その破壊は網膜疾患を引き起こす可能性があります。 RDGNの研究の進歩により、網膜の発達に関与する分子機構が明らかになりました。これらの発見は、網膜疾患の潜在的な治療戦略へのインサイトを提供しました。網膜の発達の分子機構 RDGNの研究の進歩により、網膜の発達に関与する分子機構が明らかになりました。 RDGNは、転写因子、シグナル分子、およびその他の調節タンパク質から構成されています。これらのタンパク質は、網膜の発達に関与する遺伝子の発現を調節するために相互作用します。たとえば、転写因子Pax6は、脊椎動物の網膜の形成に不可欠です。それは、網膜の発達に関与する遺伝子のプロモーター領域に結合し、その発現を活性化します。さらに、WntやHedgehogなどのシグナル分子も網膜の発達の調節に関与しています。彼らは細胞表面のレセプターに結合し、網膜の発達に関与する遺伝子の発現を調節する下流のシグナル伝達経路を活性化します。網膜疾患の潜在的な治療戦略 RDGNの研究の進歩により、網膜疾患の潜在的な治療戦略へのインサイトが得られました。たとえば、遺伝子治療を用いて、網膜の発達に関与する遺伝子の発現を回復することができます。さらに、小分子を用いてRDGNの活性を調節することもできます。たとえば、小分子を用いて、網膜の発達に関与する転写因子やシグナル分子の活性を阻害することができます。最後に、幹細胞療法を用いて、損傷した網膜細胞を置き換えることができます。幹細胞は、網膜細胞に分化させて眼内に移植することで、損傷した細胞を置き換えることができます。これらの治療戦略は、RDGNの破壊によって引き起こされる網膜疾患の治療に使用することができます。要約した論文について published: 2023;

: ja

P53異常とTFE3遺伝子増幅は腎の上皮性血管肉腫における有害予後の予測因子になり得る

研究の概要上皮性血管肉腫（EAML）は、腎細胞癌と誤診されることが多い稀な腎腫瘍です。本研究の目的は、EAMLにおける有害予後の予測因子を特定することでした。本研究には、EAMLを有する合計24人の患者が含まれていました。研究者らは、p53の異常とTFE3遺伝子増幅がEAMLにおける有害予後と関連していることを見出しました。本研究の結果から、p53の異常とTFE3遺伝子増幅は、EAMLにおける有害予後の予測因子として有用である可能性が示唆されました。研究の詳細な概要上皮性血管肉腫（EAML）は、腎細胞癌と誤診されることが多い稀な腎腫瘍です。上皮、平滑筋、脂肪の変動度を特徴としています。EAMLの予後は一般的に良好ですが、一部の場合は有害な結果と関連する可能性があります。したがって、EAMLにおける有害予後の予測因子を特定することは重要です。本研究では、研究者らはEAMLにおける有害予後の予測因子を特定することを目的としました。本研究には、2000年1月から2018年12月の間に放射線治療または部分腎摘除を受けた合計24人の患者が含まれていました。研究者らは患者の臨床病理学的特徴を分析し、p53およびTFE3のイムノヒストケミカル染色を行いました。本研究の結果、p53の異常とTFE3遺伝子増幅がEAMLにおける有害予後と関連していることが明らかになりました。研究者らはまた、上皮成分の存在、腫瘍サイズ、リンパ節転移が有害予後と関連していることを見出しました。本研究の結果から、p53の異常とTFE3遺伝子増幅は、EAMLにおける有害予後の予測因子として有用である可能性が示唆されました。これらの結果を確認し、これらの結果の臨床的意義を決定するためには、さらなる研究が必要です。要約した論文について published: 2023;

: ja

コテシア・ブラコウウイルスの新しい遺伝子ファミリー（BAPs）が宿主ヘモサイトのアポトーシスを誘導する

研究の概要本研究では、コテシア・ブラコウウイルスの新しい遺伝子ファミリー（BAPs）が特定された。 BAPs遺伝子ファミリーは、BAP1、BAP2、BAP3、およびBAP4の4つの遺伝子から構成されている。 BAPs遺伝子ファミリーは、宿主ヘモサイトに発現し、宿主ヘモサイトのアポトーシスを誘導する。 BAPs遺伝子ファミリーは、宿主免疫応答の調節に関与している。 BAPs遺伝子ファミリーは、コテシア・ブラコウウイルスの感染に成功するために不可欠である。研究の詳細な概要本研究では、コテシア・ブラコウウイルスの新しい遺伝子ファミリー（BAPs）が特定された。 BAPs遺伝子ファミリーは、BAP1、BAP2、BAP3、およびBAP4の4つの遺伝子から構成されている。 BAPs遺伝子ファミリーは、宿主ヘモサイトに発現し、宿主ヘモサイトのアポトーシスを誘導する。 BAPs遺伝子ファミリーは、宿主免疫応答の調節に関与している。 BAPs遺伝子ファミリーは、コテシア・ブラコウウイルスの感染に成功するために不可欠である。BAPs遺伝子ファミリーは、コテシア・ブラコウウイルスの転写産物解析によって特定された。 BAPs遺伝子ファミリーは、宿主ヘモサイトに発現し、宿主ヘモサイトのアポトーシスを誘導することが分かった。 BAPs遺伝子ファミリーはまた、宿主免疫応答の調節に関与していることが分かった。BAPs遺伝子ファミリーは、コテシア・ブラコウウイルスの感染に成功するために不可欠であることが分かった。 BAPs遺伝子ファミリーは、感染プロセス中に宿主ヘモサイトで上昇していることが分かった。 BAPs遺伝子ファミリーはまた、宿主免疫応答の調節に関与していることが分かった。本研究の結果は、BAPs遺伝子ファミリーがコテシア・ブラコウウイルスの感染に成功するために不可欠であることを示している。 BAPs遺伝子ファミリーは、宿主免疫応答の調節に関与し、宿主ヘモサイトのアポトーシスを誘導する。本研究の結果は、コテシア・ブラコウウイルス感染プロセスの分子機構に関する新しい知見を提供している。要約した論文について published: 2023;

: ja

mRNAワクチンおよび以前の感染によるSARS-CoV-2感染の遺伝的影響を重み付けられた遺伝子共発現ネットワークによって識別する

研究の概要本研究の目的は、mRNAワクチンおよび以前の感染の遺伝的影響をSARS-CoV-2感染において識別することである。著者らは、mRNAワクチンおよび以前の感染に関連する遺伝子モジュールを識別するために重み付けられた遺伝子共発現ネットワーク解析（WGCNA）を用いた。著者らは、mRNAワクチンおよび以前の感染に関連する2つの遺伝子モジュールを識別した。著者らは、mRNAワクチン関連の遺伝子モジュールが免疫応答および炎症に関与する遺伝子に富んでいることを見出した。著者らはまた、以前の感染関連の遺伝子モジュールが細胞周期およびDNAの複製に関与する遺伝子に富んでいることを見出した。著者らは、mRNAワクチンおよび以前の感染がSARS-CoV-2感染において異なる遺伝的影響をもたらすことを結論付けた。研究の詳細な概要本研究の目的は、mRNAワクチンおよび以前の感染の遺伝的影響をSARS-CoV-2感染において識別することである。そのために、著者らは、mRNAワクチンおよび以前の感染に関連する遺伝子モジュールを識別するために重み付けられた遺伝子共発現ネットワーク解析（WGCNA）を用いた。著者らは、1000 Genomes Projectからデータを用いて、mRNAワクチンおよび以前の感染に関連する遺伝子モジュールを識別した。著者らは、mRNAワクチンおよび以前の感染に関連する2つの遺伝子モジュールを識別した。mRNAワクチン関連の遺伝子モジュールは、免疫応答および炎症に関与する遺伝子に富んでいた。以前の感染関連の遺伝子モジュールは、細胞周期およびDNAの複製に関与する遺伝子に富んでいた。著者らは、mRNAワクチンおよび以前の感染がSARS-CoV-2感染において異なる遺伝的影響をもたらすことを結論付けた。著者らは、mRNAワクチンおよび以前の感染がSARS-CoV-2感染における遺伝的影響のメカニズムを理解するために、さらなる研究が必要であると提案した。要約した論文について published: 2023 Mar;

: ja

遺伝子発現データに基づく乳がん予後スコアの評価と比較

要約（箇条書き）本研究では、遺伝子発現データに基づく4つの異なる乳がん予後スコアを評価・比較した。 4つのスコアは、Prognostic Index（PI）、Prognostic Index Plus（PI+）、Prognostic Index Plus 2（PI+2）、Prognostic Index Plus 3（PI+3）である。本研究では、METABRIC研究から8845人の乳がん患者のデータセットを用いた。 4つのスコアの性能は、受信者操作特性曲線（AUC）と一致指数（C-index）を用いて評価した。結果は、PI+3スコアが最も高いAUCとC-index値を示し、乳がん予後を予測する最も正確なスコアであることを示した。結果はまた、データセットが腫瘍亜型に分割された場合、PI+2スコアが最も高いAUCとC-index値を示した。本研究の結論として、PI+3スコアが乳がん予後を予測する最も正確なスコアである一方、PI+2スコアが特定の腫瘍亜型の予後を予測する最も正確なスコアであることが示された。要約（3500文字以上）本研究では、遺伝子発現データに基づく4つの異なる乳がん予後スコアを評価・比較した。4つのスコアは、Prognostic Index（PI）、Prognostic Index Plus（PI+）、Prognostic Index Plus 2（PI+2）、Prognostic Index Plus 3（PI+3）である。本研究では、METABRIC研究から8845人の乳がん患者のデータセットを用いた。4つのスコアの性能は、受信者操作特性曲線（AUC）と一致指数（C-index）を用いて評価した。 4つのスコアの性能結果は、PI+3スコアが最も高いAUCとC-index値を示し、乳がん予後を予測する最も正確なスコアであることを示した。結果はまた、データセットが腫瘍亜型に分割された場合、PI+2スコアが最も高いAUCとC-index値を示した。結論本研究の結論として、PI+3スコアが乳がん予後を予測する最も正確なスコアである一方、PI+2スコアが特定の腫瘍亜型の予後を予測する最も正確なスコアであることが示された。本研究は、異なる乳がん予後スコアの性能を評価する上で有用な洞察を提供し、研究における予後スコアの選択についての情報を提供することができる。要約した論文について published: 2023;

PREV: Cloning and characterization of nitrate reductase gene in kelp Saccharina japonica (Laminariales, Phaeophyta)
NEXT: Genome-wide identification, characterization, and expression pattern of the late embryogenesis abundant (LEA) gene family in Juglans regia and its wild relatives J. mandshurica