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ジュグランス・レギアおよびその野生種ジュグランス・マンシュリカにおける遅発性胚発生特異的遺伝子ファミリー(LEA)のゲノムワイドな同定、特徴付け、および発現パターン

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研究の概要

  • 本研究の目的は、ジュグランス・レギアおよびその野生種ジュグランス・マンシュリカにおける遅発性胚発生特異的遺伝子ファミリー(LEA)を同定、特徴付け、および分析することである。
  • 本研究では、LEA遺伝子を同定および特徴付けるために、バイオインフォマティクスおよび分子生物学的技術を組み合わせて用いた。
  • 本研究では、ジュグランス・レギアおよびジュグランス・マンシュリカにおいて、4つのサブファミリーに分類された計28のLEA遺伝子を同定した。
  • LEA遺伝子の発現パターンを定量的リアルタイムPCR(qRT-PCR)を用いて分析した結果、ジュグランス・レギアにおけるLEA遺伝子の発現は、ジュグランス・マンシュリカに比べて有意に高かった。
  • LEA遺伝子においていくつかの保存的なモチーフも同定され、これらはLEA遺伝子の発現制御に関与している可能性がある。

研究の詳細な概要

遅発性胚発生特異的遺伝子ファミリー(LEA)は、植物の胚発生の遅い段階で高く発現し、環境ストレスから細胞を保護するのに関与する遺伝子のグループである。本研究では、ジュグランス・レギアおよびその野生種ジュグランス・マンシュリカにおけるLEA遺伝子ファミリーを同定、特徴付け、および分析することを目的とした。そのために、本研究では、バイオインフォマティクスおよび分子生物学的技術を組み合わせて用いた。本研究では、ジュグランス・レギアおよびジュグランス・マンシュリカにおけるLEA遺伝子を、類縁性に基づくアプローチとデノヴォアプローチを組み合わせて同定した。ジュグランス・レギアおよびジュグランス・マンシュリカにおいて、4つのサブファミリーに分類された計28のLEA遺伝子が同定された。次に、定量的リアルタイムPCR(qRT-PCR)を用いてLEA遺伝子の発現パターンを分析した。その結果、ジュグランス・レギアにおけるLEA遺伝子の発現は、ジュグランス・マンシュリカに比べて有意に高かったことがわかった。また、LEA遺伝子においていくつかの保存的なモチーフも同定され、これらはLEA遺伝子の発現制御に関与している可能性がある。さらに、LEA遺伝子の系統解析を行い、ジュグランス・レギアおよびジュグランス・マンシュリカのLEA遺伝子は密接に関連していることがわかった。本研究の結果、ジュグランス・レギアおよびジュグランス・マンシュリカにおけるLEA遺伝子ファミリーは高度に保存されており、細胞を環境ストレスから保護するのに重要な役割を果たしている可能性があることが示唆された。全体として、本研究は、ジュグランス・レギアおよびジュグランス・マンシュリカにおけるLEA遺伝子ファミリーに関する包括的な概要を提供した。本研究では、ジュグランス・レギアおよびジュグランス・マンシュリカにおいて、4つのサブファミリーに分類された計28のLEA遺伝子を同定した。定量的リアルタイムPCR(qRT-PCR)を用いてLEA遺伝子の発現パターンを分析した結果、ジュグランス・レギアにおけるLEA遺伝子の発現は、ジュグランス・マンシュリカに比べて有意に高かった。また、LEA遺伝子においていくつかの保存的なモチーフも同定され、これらはLEA遺伝子の発現制御に関与している可能性がある。本研究は、ジュグランス・レギアおよびジュグランス・マンシュリカにおけるLEA遺伝子ファミリーに関する有用な知見を提供し、細胞を

要約した論文について

published: 2023;
Genome-wide identification, characterization, and expression pattern of the late embryogenesis abundant (LEA) gene family in Juglans regia and its wild relatives J. mandshurica

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