クロマチン関連RNAが遺伝子制御とがんにおける役割

投稿日：2023-02-16

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9903551/の概要

クロマチン関連RNA（caRNA）は、クロマチンに関連しており、遺伝子制御に関与する非コードRNAのクラスです。
caRNAは、転写制御、エピゲノム制御、および後転写制御など、さまざまな生物学的プロセスに関与しています。
caRNAは、オンコゲノムや腫瘍抑制遺伝子の発現を制御することで、がんの発症にも関与しています。
最近の研究では、lncRNA、miRNA、およびsnoRNAなど、がんに関連する多数のcaRNAが同定されています。
これらのcaRNAは、がんの診断と予後のためのバイオマーカーとして使用でき、潜在的な治療標的としても使用できます。

クロマチン関連RNA：新しい非コードRNAのクラス

クロマチン関連RNA（caRNA）は、クロマチンに関連しており、遺伝子制御に関与する新しく発見された非コードRNAのクラスです。 caRNAは、転写制御、エピゲノム制御、および後転写制御など、さまざまな生物学的プロセスに関与しています。 caRNAは、オンコゲノムや腫瘍抑制遺伝子の発現を制御することで、がんの発症にも関与しています。最近の研究では、lncRNA、miRNA、およびsnoRNAなど、がんに関連する多数のcaRNAが同定されています。これらのcaRNAは、がんの診断と予後のためのバイオマーカーとして使用でき、潜在的な治療標的としても使用できます。caRNAは、DNA、RNA、およびタンパク質に結合して遺伝子発現を制御し、クロマチン構造を変化させるクロマチン修飾酵素と相互作用して、遺伝子発現を制御することもできます。 caRNAは、転写活性化剤または抑制剤としての役割を果たしたり、mRNA転写物の安定性を調節したりすることで、遺伝子発現を制御することもできます。

caRNAとがん

caRNAは、オンコゲノムや腫瘍抑制遺伝子の発現を制御することで、がんの発症にも関与しています。最近の研究では、lncRNA、miRNA、およびsnoRNAなど、がんに関連する多数のcaRNAが同定されています。これらのcaRNAは、がんの診断と予後のためのバイオマーカーとして使用でき、潜在的な治療標的としても使用できます。例えば、lncRNAは、オンコゲノムや腫瘍抑制遺伝子の制御に関与しており、がんの診断と予後のためのバイオマーカーとして使用できます。 miRNAは、オンコゲノムや腫瘍抑制遺伝子の制御に関与しており、がんの診断と予後のためのバイオマーカーとして使用できます。 snoRNAは、オンコゲノムや腫瘍抑制遺伝子の制御に関与しており、がんの診断と予後のためのバイオマーカーとして使用できます。さらに、caRNAは、がんの治療標的としても使用できます。例えば、lncRNAは、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたは小さな干渉性RNA（siRNA）を用いて阻害することができます。 miRNAは、アンタゴミルまたはmiRNA阻害剤を用いて阻害することができます。 snoRNAは、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはsiRNAを用いて阻害することができます。

結論

結論として、caRNAは、クロマチンに関連しており、遺伝子制御に関与する新しく発見された非コードRNAのクラスです。 caRNAは、転写制御、エピゲノム制御、および後転写制御など、さまざまな生物学的プロセスに関与しています。 caRNAは、オンコゲノムや腫瘍抑制遺伝子の発現を制御することで、がんの発症にも関与しています。最近の研究では、lncRNA、miRNA、およびsnoRNAなど、がんに関連する多数のcaRNAが同定されています。これらのcaRNAは、がんの診断と予後のためのバイオマーカーとして使用でき、潜在的な治療標的としても使

要約した論文について

published: 2023;
The chromatin-associated RNAs in gene regulation and cancer

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リー氏らによる、アルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良ラクトバチルスケーシー（L. casei）のイムノジェニシティに関する研究。Vaccines 2021、9、1084

リー氏らは、ポーク流行性下痢ウイルス（PEDV）に対するアルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良ラクトバチルスケーシー（L. casei）のイムノジェニシティを評価するための研究を行った。この研究は、マウスモデルを用いて行われ、結果として、アルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良L. caseiがPEDVに対して強力な免疫反応を誘導することが示された。また、結果は、アルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良L. caseiが強力な体液免疫反応および強力な細胞免疫反応を誘導することを示した。この研究は、アルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良L. caseiのイムノジェニシティを評価するために、マウスモデルを用いて行われた。実験では、マウスをアルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良L. caseiで免疫し、結果としてPEDVに対する強力な免疫反応が誘導されたことが示された。結果は、免疫によりPEDVに対する強力な体液免疫反応が誘導されたことを示した。また、IFN-γおよびIL-4サイトカインの産生を測定した結果、免疫により強力な細胞免疫反応が誘導されたことも示された。この研究は、アルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良L. caseiがPEDVの感染予防のための有望なワクチン候補であることを結論付けた。研究の結果は、アルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良L. caseiがPEDVに対して強力な体液免疫反応および強力な細胞免疫反応を誘導することを示した。この研究の結果から、アルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良L. caseiがPEDVの感染予防のためのワクチン候補として有望であることが示唆された。結論リー氏らは、ポーク流行性下痢ウイルス（PEDV）に対するアルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良ラクトバチルスケーシー（L. casei）のイムノジェニシティを評価するための研究を行った。この研究は、マウスモデルを用いて行われ、結果として、アルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良L. caseiがPEDVに対して強力な体液免疫反応および強力な細胞免疫反応を誘導することが示された。この研究は、アルニンレースマーゼ遺伝子およびコア中和性抗原抗体を発現する再生不良L. caseiがPEDVの感染予防のための有望なワクチン候補であることを結論付けた。要約した論文について published: 2023 Feb;

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ハイライト：苔類におけるナチュラルサンスクリーンの進化における遺伝子クラスターの再配列

要約（バレットポイント）苔類は真菌と藻類からなる共生生物です。苔類は、サンスクリーンを含む様々な二次代謝物を生成することで知られています。本研究では、苔類におけるサンスクリーンの生成の進化を調査しました。彼らは、苔類におけるサンスクリーンの生成の進化において、遺伝子クラスターの再配列が主な駆動力であることを見出しました。遺伝子クラスターの再配列により、新しいサンスクリーンの速やかな進化が可能となります。本研究は、苔類におけるサンスクリーンの生成の進化に関する洞察を提供します。詳細な要約苔類は真菌と藻類からなる独特な共生生物です。彼らは、サンスクリーンを含む様々な二次代謝物を生成することで知られています。本研究では、苔類におけるサンスクリーンの生成の進化を調査しました。彼らは、ゲノム、転写産物、および代謝産物のデータを組み合わせて、苔類におけるサンスクリーンの生成の進化を分析しました。研究者らは、苔類におけるサンスクリーンの生成の進化において、遺伝子クラスターの再配列が主な駆動力であることを見出しました。遺伝子クラスターとは、ゲノム上で近接して配置された遺伝子のグループであり、二次代謝物の生成に関与すると考えられています。研究者らは、サンスクリーンの生成に関与する遺伝子クラスターが異なる苔類種において再配列されていることを見出しました。この遺伝子クラスターの再配列により、新しいサンスクリーンの速やかな進化が可能となります。本研究は、苔類におけるサンスクリーンの生成の進化に関する洞察を提供します。発見は、苔類におけるサンスクリーンの生成の進化において、遺伝子クラスターの再配列が主な駆動力であることを示唆しています。これは、人間の健康や化粧品における新しいサンスクリーンの開発において重要な意味を持つ可能性があります。要約した論文について published: 2023 Feb;

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デルマトミーオサイティスまたはポリミオサイティス患者における間質性肺疾患に伴う自発性肺胸膜中隔空洞症の予後：抗メラノーマ分化関連遺伝子5抗体状態による後ろ向きコホート研究

研究の概要本研究の目的は、デルマトミーオサイティスまたはポリミオサイティス（DM/PM）患者における間質性肺疾患（ILD）に伴う自発性肺胸膜中隔空洞症（SPM）の予後を、抗メラノーマ分化関連遺伝子5（MDA5）抗体状態によって調査することである。 2011年1月から2018年12月まで、中国医科大学第一附属病院リウマチ科に入院したDM/PM患者におけるILDを対象とした後ろ向きコホート研究が行われた。結果は、MDA5抗体陽性群はMDA5抗体陰性群よりもSPMの発症率が高かった（P＜0.001）ことを示した。 MDA5抗体陽性群はMDA5抗体陰性群よりも死亡率が高かった（P＝0.001）。 MDA5抗体陽性群はMDA5抗体陰性群よりもSPMの再発率が高かった（P＝0.001）。 MDA5抗体陽性群はMDA5抗体陰性群よりも合併症の発症率が高かった（P＝0.001）。本研究の結果から、MDA5抗体状態はDM/PM患者におけるILDに伴うSPMの予後を予測する上で重要な予測因子であることが示唆された。研究の詳細自発性肺胸膜中隔空洞症（SPM）は、胸腔内に空気が存在する稀な臨床状態を特徴とする。それは通常、肺胞または支気管の破裂によって引き起こされ、喘息、嚢胞性線維症、間質性肺疾患（ILD）などの基礎疾患と関連している。SPMの予後は通常不良であり、死亡率が高い。本研究の目的は、デルマトミーオサイティスまたはポリミオサイティス（DM/PM）患者におけるILDに伴うSPMの予後を、抗メラノーマ分化関連遺伝子5（MDA5）抗体状態によって調査することである。2011年1月から2018年12月まで、中国医科大学第一附属病院リウマチ科に入院したDM/PM患者におけるILDを対象とした後ろ向きコホート研究が行われた。患者はMDA5抗体状態によって2つの群に分けられた：MDA5抗体陽性群とMDA5抗体陰性群。主要転帰はSPMの発症率であり、副次転帰は死亡率、再発率、合併症率であった。結果は、MDA5抗体陽性群はMDA5抗体陰性群よりもSPMの発症率が高かった（P＜0.001）ことを示した。MDA5抗体陽性群はMDA5抗体陰性群よりも死亡率が高かった（P＝0.001）。MDA5抗体陽性群はMDA5抗体陰性群よりもSPMの再発率が高かった（P＝0.001）。MDA5抗体陽性群はMDA5抗体陰性群よりも合併症の発症率が高かった（P＝0.001）。本研究の結果から、MDA5抗体状態はDM/PM患者におけるILDに伴うSPMの予後を予測する上で重要な予測因子であることが示唆された。これらの結果を確認し、背景機序を探るためには、さらなる研究が必要である。要約した論文について published: 2023;

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ドーパミントランスポーター遺伝子（SLC6A3）における新規ハイパーバリアブル変数数タンデムリピートの発見

研究の概要本研究の目的は、ドーパミントランスポーター遺伝子（SLC6A3）における新規ハイパーバリアブル変数数タンデムリピート（VNTR）を特定することである。本研究では、PCRとサンガーシーケンシングを組み合わせてVNTRを特定した。 VNTRはSLC6A3遺伝子の3’非翻訳領域に位置していることが判明した。 VNTRは、2つの長さの異なるアレルからなる多型であることが判明した。 VNTRはSLC6A3遺伝子の発現と関連していることが判明した。 VNTRは、特定の精神疾患の発症リスクと関連していることが判明した。研究の詳細本研究では、ドーパミントランスポーター遺伝子（SLC6A3）における新規ハイパーバリアブル変数数タンデムリピート（VNTR）を特定することを目的とした。そのために、PCRとサンガーシーケンシングを組み合わせてVNTRを特定した。VNTRはSLC6A3遺伝子の3’非翻訳領域に位置していることが判明した。また、2つの長さの異なるアレルからなる多型であることが判明した。VNTRはSLC6A3遺伝子の発現と関連していることが判明した。さらに、VNTRは、特定の精神疾患の発症リスクと関連していることが判明した。研究者らは、VNTRがSLC6A3遺伝子の発現にどのような役割を果たすかをさらに調査するために、一連の実験を行った。彼らは、異なるアレルのVNTRを持つ細胞でSLC6A3遺伝子の発現を測定するために、ルシファーゼレポーターアッセイを用いた。その結果、VNTRの長いアレルを持つ細胞では、SLC6A3遺伝子の発現が有意に高かったことが判明した。研究者らは、VNTRと特定の精神疾患の発症リスクとの関連を調査するために、ケースコントロール研究を行った。その結果、VNTRの長いアレルを持つ個体は、統合失調症やバイポーラー障害などの精神疾患の発症リスクが高いことが判明した。結論結論として、本研究では、ドーパミントランスポーター遺伝子（SLC6A3）における新規ハイパーバリアブル変数数タンデムリピート（VNTR）を特定した。VNTRはSLC6A3遺伝子の3’非翻訳領域に位置していることが判明した。また、2つの長さの異なるアレルからなる多型であることが判明した。VNTRはSLC6A3遺伝子の発現と関連していることが判明した。さらに、VNTRは、特定の精神疾患の発症リスクと関連していることが判明した。これらの結果から、VNTRは、精神疾患の診断と治療に有用なマーカーとなる可能性が示唆された。要約した論文について published: 2023 Apr;

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RPGR遺伝子変異によるX-Linked Retinitis PigmentosaにおけるCotoretigene Toliparvovecに伴う視細胞感度の変化

主要な要点の概要 Cotoretigene toliparvovec（AAV2-RPGR）は、RPGR遺伝子の突然変異によるX-Linked Retinitis Pigmentosa（XLRP）の治療に使用される遺伝子治療法です。 XLRP患者におけるAAV2-RPGRの安全性と有効性を評価するための研究が行われました。研究の結果、AAV2-RPGRは安全で耐受性が良好であり、治療された眼で視細胞感度が改善されました。視細胞感度の改善は、治療後12か月間も維持されました。これらの結果から、AAV2-RPGRはRPGR遺伝子変異によるXLRPの治療に有望な治療法であると考えられます。詳細な概要 X-Linked Retinitis Pigmentosa（XLRP）は、RPGR遺伝子の突然変異による稀な遺伝性視細胞退行性疾患です。それは、進行性の視力低下、夜間失明、視野狭窄などの特徴を持ちます。Cotoretigene toliparvovec（AAV2-RPGR）は、RPGR遺伝子の突然変異によるXLRPの治療に使用される遺伝子治療法です。XLRP患者におけるAAV2-RPGRの安全性と有効性を評価するための研究が行われました。この研究では、RPGR遺伝子変異によるXLRPを有する12人の患者を対象に、AAV2-RPGRを1眼に投与し、他の眼にはシャム手術を行った。主要な治療効果指標は、治療前と治療後12か月での視細胞感度の変化でした。研究の結果、AAV2-RPGRは安全で耐受性が良好であり、重大な有害事象は報告されませんでした。治療された眼では、シャム手術を受けた眼に比べて、視細胞感度が有意に改善され、治療後12か月間も改善が維持されました。これらの結果から、AAV2-RPGRはRPGR遺伝子変異によるXLRPの治療に有望な治療法であると考えられます。より大規模な患者集団におけるAAV2-RPGRの安全性と有効性を確認するためには、さらなる研究が必要です。要約した論文について published: 2023 Feb 9

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